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An Identification Method of Data-Specific GO Terms from a Microarray Data Set 마이크로어레이 데이터 세트에서 데이터별 GO 용어의 식별 방법

Yoichi YAMADA, Ken-ichi HIROTANI, Kenji SATOU, Ken-ichiro MURAMOTO

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요약 :

마이크로어레이 기술은 다양한 생물학 및 의학 연구 분야에 적용되어 왔습니다. 마이크로어레이 데이터 세트에서 정보를 추출하기 위한 예비 단계는 마이크로어레이 데이터 간에 차별적으로 발현된 유전자를 식별하는 것입니다. 차등적으로 발현되는 유전자와 일반적으로 연관된 GO 용어를 식별하면 자극 의존적 또는 질병 관련 유전자 및 생물학적 사건 등을 찾을 수 있습니다. 그러나 유전자 세트 농축 분석(GSEA)을 포함한 일반적인 접근법을 통해 규제가 완화된 GO 용어를 식별합니다. )는 마이크로어레이 데이터 세트 중 특정 데이터에서 과도하게 표현된 GO 용어(즉, 데이터별 GO 용어)를 반드시 제공하지는 않습니다. 본 논문에서는 데이터별 GO 항을 정확하게 식별하고 실제 마이크로어레이 데이터 세트를 이용한 시뮬레이션을 통해 가용성을 추정하는 통계적 방법을 제안합니다.

발행
IEICE TRANSACTIONS on Information Vol.E92-D No.5 pp.1093-1102
발행일
2009/05/01
공개일
온라인 ISSN
1745-1361
DOI
10.1587/transinf.E92.D.1093
원고의 종류
PAPER
범주
데이터 마이닝

작성자

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